Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERFP50548 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERFP50548 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERFP50548 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERFP50548 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ERFP50548 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ERFP50548 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERFP50548 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERFP50548 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERFP50548 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ERFP50548 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERFP50548 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERFP50548 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERFP50548 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERFP50548 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERFP50548 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERFP50548 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERFP50548 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERFP50548 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERFP50548 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERFP50548 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERFP50548 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERFP50548 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERFP50548 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERFP50548 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERFP50548 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERFP50548 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERFP50548 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERFP50548 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERFP50548 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERFP50548 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERFP50548 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERFP50548 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERFP50548 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERFP50548 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERFP50548 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERFP50548 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERFP50548 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERFP50548 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERFP50548 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERFP50548 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERFP50548 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERFP50548 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERFP50548 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERFP50548 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERFP50548 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERFP50548 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERFP50548 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERFP50548 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERFP50548 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERFP50548 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERFP50548 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERFP50548 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERFP50548 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERFP50548 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERFP50548 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERFP50548 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERFP50548 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERFP50548 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERFP50548 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERFP50548 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERFP50548 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERFP50548 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERFP50548 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ERFP50548 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERFP50548 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERFP50548 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERFP50548 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ERFP50548 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERFP50548 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERFP50548 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERFP50548 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERFP50548 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERFP50548 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERFP50548 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERFP50548 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERFP50548 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERFP50548 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERFP50548 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERFP50548 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ERFP50548 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERFP50548 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERFP50548 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERFP50548 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERFP50548 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERFP50548 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERFP50548 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERFP50548 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERFP50548 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERFP50548 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ERFP50548 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERFP50548 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ERFP50548 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ERFP50548 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERFP50548 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERFP50548 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERFP50548 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERFP50548 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERFP50548 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERFP50548 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms