Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ETV4P43268 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ETV4P43268 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ETV4P43268 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ETV4P43268 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ETV4P43268 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ETV4P43268 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ETV4P43268 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ETV4P43268 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ETV4P43268 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ETV4P43268 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ETV4P43268 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ETV4P43268 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ETV4P43268 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ETV4P43268 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ETV4P43268 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ETV4P43268 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ETV4P43268 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ETV4P43268 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ETV4P43268 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ETV4P43268 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ETV4P43268 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ETV4P43268 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ETV4P43268 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ETV4P43268 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ETV4P43268 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ETV4P43268 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ETV4P43268 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ETV4P43268 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ETV4P43268 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ETV4P43268 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ETV4P43268 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ETV4P43268 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ETV4P43268 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ETV4P43268 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ETV4P43268 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ETV4P43268 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ETV4P43268 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ETV4P43268 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ETV4P43268 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ETV4P43268 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ETV4P43268 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ETV4P43268 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ETV4P43268 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ETV4P43268 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ETV4P43268 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ETV4P43268 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ETV4P43268 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ETV4P43268 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ETV4P43268 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ETV4P43268 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ETV4P43268 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ETV4P43268 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ETV4P43268 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ETV4P43268 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ETV4P43268 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ETV4P43268 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ETV4P43268 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ETV4P43268 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ETV4P43268 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ETV4P43268 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ETV4P43268 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ETV4P43268 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ETV4P43268 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ETV4P43268 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ETV4P43268 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ETV4P43268 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ETV4P43268 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ETV4P43268 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETV4P43268 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETV4P43268 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETV4P43268 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETV4P43268 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETV4P43268 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETV4P43268 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETV4P43268 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETV4P43268 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETV4P43268 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETV4P43268 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETV4P43268 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETV4P43268 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETV4P43268 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETV4P43268 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETV4P43268 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETV4P43268 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETV4P43268 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETV4P43268 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETV4P43268 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETV4P43268 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ETV4P43268 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETV4P43268 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETV4P43268 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETV4P43268 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETV4P43268 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETV4P43268 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETV4P43268 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETV4P43268 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETV4P43268 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETV4P43268 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETV4P43268 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms