Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CRATP43155 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CRATP43155 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CRATP43155 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CRATP43155 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CRATP43155 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CRATP43155 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CRATP43155 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CRATP43155 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CRATP43155 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CRATP43155 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CRATP43155 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CRATP43155 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CRATP43155 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CRATP43155 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CRATP43155 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CRATP43155 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CRATP43155 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CRATP43155 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CRATP43155 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CRATP43155 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CRATP43155 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CRATP43155 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CRATP43155 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CRATP43155 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CRATP43155 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CRATP43155 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CRATP43155 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CRATP43155 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CRATP43155 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CRATP43155 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CRATP43155 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CRATP43155 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CRATP43155 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CRATP43155 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CRATP43155 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CRATP43155 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CRATP43155 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CRATP43155 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CRATP43155 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CRATP43155 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CRATP43155 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CRATP43155 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CRATP43155 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CRATP43155 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CRATP43155 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CRATP43155 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CRATP43155 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CRATP43155 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CRATP43155 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CRATP43155 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CRATP43155 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CRATP43155 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CRATP43155 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CRATP43155 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CRATP43155 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CRATP43155 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CRATP43155 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CRATP43155 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CRATP43155 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CRATP43155 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CRATP43155 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CRATP43155 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CRATP43155 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CRATP43155 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CRATP43155 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CRATP43155 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CRATP43155 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CRATP43155 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CRATP43155 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CRATP43155 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CRATP43155 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CRATP43155 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CRATP43155 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CRATP43155 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CRATP43155 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRATP43155 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRATP43155 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRATP43155 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRATP43155 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRATP43155 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRATP43155 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRATP43155 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRATP43155 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRATP43155 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRATP43155 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRATP43155 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRATP43155 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRATP43155 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRATP43155 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRATP43155 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRATP43155 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRATP43155 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRATP43155 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRATP43155 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRATP43155 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRATP43155 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRATP43155 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRATP43155 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRATP43155 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms