Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC1A2P43004 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC1A2P43004 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC1A2P43004 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC1A2P43004 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC1A2P43004 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC1A2P43004 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC1A2P43004 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC1A2P43004 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC1A2P43004 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC1A2P43004 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC1A2P43004 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC1A2P43004 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC1A2P43004 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC1A2P43004 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC1A2P43004 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC1A2P43004 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC1A2P43004 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC1A2P43004 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC1A2P43004 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC1A2P43004 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC1A2P43004 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC1A2P43004 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC1A2P43004 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC1A2P43004 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC1A2P43004 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC1A2P43004 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC1A2P43004 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC1A2P43004 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms