Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMPOP42166 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMPOP42166 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMPOP42166 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMPOP42166 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMPOP42166 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMPOP42166 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMPOP42166 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMPOP42166 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TMPOP42166 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMPOP42166 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMPOP42166 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TMPOP42166 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TMPOP42166 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMPOP42166 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TMPOP42166 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMPOP42166 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TMPOP42166 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMPOP42166 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMPOP42166 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMPOP42166 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMPOP42166 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMPOP42166 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMPOP42166 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMPOP42166 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMPOP42166 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMPOP42166 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMPOP42166 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMPOP42166 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMPOP42166 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMPOP42166 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMPOP42166 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMPOP42166 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMPOP42166 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMPOP42166 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMPOP42166 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMPOP42166 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMPOP42166 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMPOP42166 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMPOP42166 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMPOP42166 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMPOP42166 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TMPOP42166 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMPOP42166 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMPOP42166 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TMPOP42166 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMPOP42166 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMPOP42166 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMPOP42166 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMPOP42166 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMPOP42166 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMPOP42166 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMPOP42166 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMPOP42166 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMPOP42166 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMPOP42166 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMPOP42166 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMPOP42166 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMPOP42166 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMPOP42166 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMPOP42166 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMPOP42166 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TMPOP42166 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMPOP42166 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMPOP42166 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMPOP42166 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMPOP42166 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMPOP42166 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMPOP42166 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMPOP42166 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMPOP42166 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMPOP42166 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMPOP42166 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMPOP42166 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMPOP42166 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMPOP42166 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMPOP42166 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TMPOP42166 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMPOP42166 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMPOP42166 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMPOP42166 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMPOP42166 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMPOP42166 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMPOP42166 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMPOP42166 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMPOP42166 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMPOP42166 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMPOP42166 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMPOP42166 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMPOP42166 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMPOP42166 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMPOP42166 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMPOP42166 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMPOP42166 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMPOP42166 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMPOP42166 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMPOP42166 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMPOP42166 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TMPOP42166 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMPOP42166 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms