Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5DP30049 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms