Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms