Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms