Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms