Protein–RNA interactions for Protein: P23297

S100A1, Protein S100-A1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S100A1P23297 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
S100A1P23297 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
S100A1P23297 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
S100A1P23297 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
S100A1P23297 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
S100A1P23297 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
S100A1P23297 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
S100A1P23297 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
S100A1P23297 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
S100A1P23297 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
S100A1P23297 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
S100A1P23297 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
S100A1P23297 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
S100A1P23297 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
S100A1P23297 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
S100A1P23297 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
S100A1P23297 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
S100A1P23297 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
S100A1P23297 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
S100A1P23297 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
S100A1P23297 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
S100A1P23297 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
S100A1P23297 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
S100A1P23297 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
S100A1P23297 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
S100A1P23297 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
S100A1P23297 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
S100A1P23297 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
S100A1P23297 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
S100A1P23297 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
S100A1P23297 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
S100A1P23297 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
S100A1P23297 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
S100A1P23297 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
S100A1P23297 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
S100A1P23297 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
S100A1P23297 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
S100A1P23297 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
S100A1P23297 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
S100A1P23297 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
S100A1P23297 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
S100A1P23297 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
S100A1P23297 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
S100A1P23297 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
S100A1P23297 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
S100A1P23297 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
S100A1P23297 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
S100A1P23297 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
S100A1P23297 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
S100A1P23297 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
S100A1P23297 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
S100A1P23297 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
S100A1P23297 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
S100A1P23297 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
S100A1P23297 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
S100A1P23297 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
S100A1P23297 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
S100A1P23297 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
S100A1P23297 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
S100A1P23297 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
S100A1P23297 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
S100A1P23297 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
S100A1P23297 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
S100A1P23297 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
S100A1P23297 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
S100A1P23297 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
S100A1P23297 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
S100A1P23297 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
S100A1P23297 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
S100A1P23297 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
S100A1P23297 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
S100A1P23297 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
S100A1P23297 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
S100A1P23297 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
S100A1P23297 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
S100A1P23297 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
S100A1P23297 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
S100A1P23297 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
S100A1P23297 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
S100A1P23297 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
S100A1P23297 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
S100A1P23297 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
S100A1P23297 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
S100A1P23297 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
S100A1P23297 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
S100A1P23297 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
S100A1P23297 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
S100A1P23297 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
S100A1P23297 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
S100A1P23297 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
S100A1P23297 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
S100A1P23297 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
S100A1P23297 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
S100A1P23297 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
S100A1P23297 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
S100A1P23297 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
S100A1P23297 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
S100A1P23297 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
S100A1P23297 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
S100A1P23297 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms