Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms