Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms