Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms