Protein–RNA interactions for Protein: P07195

LDHB, L-lactate dehydrogenase B chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHBP07195 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LDHBP07195 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LDHBP07195 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LDHBP07195 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LDHBP07195 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LDHBP07195 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LDHBP07195 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LDHBP07195 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LDHBP07195 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LDHBP07195 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LDHBP07195 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LDHBP07195 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LDHBP07195 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LDHBP07195 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LDHBP07195 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LDHBP07195 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LDHBP07195 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LDHBP07195 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LDHBP07195 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LDHBP07195 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LDHBP07195 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LDHBP07195 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LDHBP07195 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LDHBP07195 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LDHBP07195 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LDHBP07195 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LDHBP07195 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LDHBP07195 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LDHBP07195 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LDHBP07195 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LDHBP07195 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LDHBP07195 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LDHBP07195 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LDHBP07195 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LDHBP07195 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LDHBP07195 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LDHBP07195 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LDHBP07195 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LDHBP07195 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LDHBP07195 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LDHBP07195 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LDHBP07195 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LDHBP07195 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LDHBP07195 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LDHBP07195 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LDHBP07195 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LDHBP07195 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LDHBP07195 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LDHBP07195 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LDHBP07195 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LDHBP07195 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LDHBP07195 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LDHBP07195 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LDHBP07195 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LDHBP07195 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LDHBP07195 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LDHBP07195 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LDHBP07195 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LDHBP07195 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LDHBP07195 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LDHBP07195 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LDHBP07195 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LDHBP07195 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LDHBP07195 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LDHBP07195 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LDHBP07195 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LDHBP07195 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LDHBP07195 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LDHBP07195 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LDHBP07195 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LDHBP07195 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LDHBP07195 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LDHBP07195 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LDHBP07195 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LDHBP07195 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LDHBP07195 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LDHBP07195 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LDHBP07195 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LDHBP07195 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LDHBP07195 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LDHBP07195 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LDHBP07195 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LDHBP07195 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LDHBP07195 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LDHBP07195 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LDHBP07195 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LDHBP07195 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LDHBP07195 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LDHBP07195 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LDHBP07195 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LDHBP07195 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LDHBP07195 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LDHBP07195 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LDHBP07195 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LDHBP07195 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LDHBP07195 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LDHBP07195 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LDHBP07195 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LDHBP07195 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LDHBP07195 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms