Protein–RNA interactions for Protein: O95857

TSPAN13, Tetraspanin-13, humanhuman

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN13O95857 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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TSPAN13O95857 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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TSPAN13O95857 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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TSPAN13O95857 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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TSPAN13O95857 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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TSPAN13O95857 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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TSPAN13O95857 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TSPAN13O95857 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TSPAN13O95857 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TSPAN13O95857 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TSPAN13O95857 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TSPAN13O95857 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TSPAN13O95857 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TSPAN13O95857 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TSPAN13O95857 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TSPAN13O95857 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TSPAN13O95857 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
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