Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBX6O95503 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBX6O95503 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBX6O95503 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBX6O95503 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBX6O95503 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX6O95503 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX6O95503 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX6O95503 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX6O95503 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX6O95503 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX6O95503 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX6O95503 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX6O95503 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX6O95503 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX6O95503 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX6O95503 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX6O95503 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX6O95503 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX6O95503 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX6O95503 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX6O95503 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX6O95503 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX6O95503 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX6O95503 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX6O95503 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX6O95503 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX6O95503 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX6O95503 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX6O95503 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX6O95503 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX6O95503 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX6O95503 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX6O95503 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX6O95503 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX6O95503 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CBX6O95503 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CBX6O95503 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CBX6O95503 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CBX6O95503 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CBX6O95503 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CBX6O95503 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CBX6O95503 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX6O95503 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX6O95503 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX6O95503 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX6O95503 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX6O95503 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX6O95503 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX6O95503 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX6O95503 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX6O95503 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX6O95503 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX6O95503 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX6O95503 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX6O95503 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX6O95503 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX6O95503 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX6O95503 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX6O95503 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX6O95503 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX6O95503 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX6O95503 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX6O95503 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX6O95503 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX6O95503 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX6O95503 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX6O95503 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX6O95503 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX6O95503 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX6O95503 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX6O95503 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX6O95503 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX6O95503 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX6O95503 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX6O95503 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX6O95503 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX6O95503 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX6O95503 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX6O95503 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX6O95503 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX6O95503 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX6O95503 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX6O95503 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX6O95503 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX6O95503 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX6O95503 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX6O95503 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX6O95503 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX6O95503 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX6O95503 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX6O95503 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX6O95503 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX6O95503 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX6O95503 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX6O95503 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX6O95503 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX6O95503 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX6O95503 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX6O95503 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms