Protein–RNA interactions for Protein: O95425

SVIL, Supervillin, humanhuman

Predictions only

Length 2,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVILO95425 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SVILO95425 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SVILO95425 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SVILO95425 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SVILO95425 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SVILO95425 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SVILO95425 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SVILO95425 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SVILO95425 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SVILO95425 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SVILO95425 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SVILO95425 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SVILO95425 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SVILO95425 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SVILO95425 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SVILO95425 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SVILO95425 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SVILO95425 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SVILO95425 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SVILO95425 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SVILO95425 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SVILO95425 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SVILO95425 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SVILO95425 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SVILO95425 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SVILO95425 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SVILO95425 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SVILO95425 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SVILO95425 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SVILO95425 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SVILO95425 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SVILO95425 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SVILO95425 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SVILO95425 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SVILO95425 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SVILO95425 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SVILO95425 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SVILO95425 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SVILO95425 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SVILO95425 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SVILO95425 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SVILO95425 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SVILO95425 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SVILO95425 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SVILO95425 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SVILO95425 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SVILO95425 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SVILO95425 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SVILO95425 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SVILO95425 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SVILO95425 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SVILO95425 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SVILO95425 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SVILO95425 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SVILO95425 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SVILO95425 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SVILO95425 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SVILO95425 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SVILO95425 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SVILO95425 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SVILO95425 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SVILO95425 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SVILO95425 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SVILO95425 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SVILO95425 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SVILO95425 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SVILO95425 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SVILO95425 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SVILO95425 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SVILO95425 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SVILO95425 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SVILO95425 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SVILO95425 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SVILO95425 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SVILO95425 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SVILO95425 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SVILO95425 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SVILO95425 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVILO95425 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVILO95425 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVILO95425 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVILO95425 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVILO95425 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVILO95425 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVILO95425 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVILO95425 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVILO95425 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVILO95425 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVILO95425 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVILO95425 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVILO95425 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVILO95425 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVILO95425 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVILO95425 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVILO95425 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVILO95425 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVILO95425 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVILO95425 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVILO95425 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVILO95425 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms