Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNKO75909 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNKO75909 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNKO75909 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNKO75909 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNKO75909 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNKO75909 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNKO75909 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNKO75909 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNKO75909 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNKO75909 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNKO75909 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNKO75909 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNKO75909 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNKO75909 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNKO75909 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNKO75909 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNKO75909 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNKO75909 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNKO75909 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNKO75909 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNKO75909 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNKO75909 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNKO75909 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNKO75909 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNKO75909 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNKO75909 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNKO75909 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNKO75909 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNKO75909 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNKO75909 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNKO75909 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNKO75909 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNKO75909 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNKO75909 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNKO75909 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNKO75909 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNKO75909 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNKO75909 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNKO75909 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNKO75909 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNKO75909 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNKO75909 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNKO75909 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNKO75909 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNKO75909 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNKO75909 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNKO75909 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNKO75909 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNKO75909 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNKO75909 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNKO75909 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNKO75909 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNKO75909 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNKO75909 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNKO75909 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNKO75909 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNKO75909 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNKO75909 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCNKO75909 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNKO75909 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNKO75909 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNKO75909 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNKO75909 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNKO75909 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNKO75909 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNKO75909 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNKO75909 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNKO75909 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNKO75909 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNKO75909 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNKO75909 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNKO75909 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNKO75909 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNKO75909 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNKO75909 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNKO75909 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNKO75909 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNKO75909 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNKO75909 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNKO75909 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNKO75909 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNKO75909 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNKO75909 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNKO75909 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNKO75909 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNKO75909 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNKO75909 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNKO75909 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNKO75909 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNKO75909 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNKO75909 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNKO75909 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNKO75909 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNKO75909 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNKO75909 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNKO75909 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNKO75909 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNKO75909 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNKO75909 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms