Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms