Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.364e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 APBB2-206ENST00000503503 544 ntTSL 523.48■■□□□ 1.354e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 ADCY7-204ENST00000562623 333 ntTSL 223.37■■□□□ 1.334e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 DNPEP-204ENST00000373966 1875 ntTSL 523.33■■□□□ 1.324e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.324e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.314e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.34e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 DHODH-209ENST00000576145 843 ntTSL 523.17■■□□□ 1.34e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.294e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 RFNG-204ENST00000578676 1078 ntTSL 322.99■■□□□ 1.274e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 MBTPS1-210ENST00000565863 597 ntTSL 422.94■■□□□ 1.264e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 KCTD13-201ENST00000308768 1685 ntTSL 222.79■■□□□ 1.244e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.231e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.224e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 TMX4-202ENST00000462384 873 ntTSL 522.57■■□□□ 1.24e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 ASL-202ENST00000362000 928 ntTSL 222.55■■□□□ 1.24e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 TFDP2-216ENST00000491667 566 ntTSL 222.53■■□□□ 1.24e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.184e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.174e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 TRIM8-204ENST00000487927 761 ntTSL 322.26■■□□□ 1.154e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 CHN1-212ENST00000469597 584 ntTSL 422.25■■□□□ 1.154e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 EPHX1-203ENST00000445856 567 ntTSL 222.18■■□□□ 1.144e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.144e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.134e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 APBB2-212ENST00000506999 565 ntTSL 522.06■■□□□ 1.124e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 APBB2-215ENST00000508676 604 ntTSL 222.06■■□□□ 1.124e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 ST6GAL1-222ENST00000487031 592 ntTSL 421.96■■□□□ 1.114e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.114e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.14e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 MBTPS1-213ENST00000569770 763 ntTSL 321.87■■□□□ 1.094e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 LINC00094-202ENST00000550853 1068 ntTSL 221.87■■□□□ 1.094e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.094e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.084e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 APBB2-217ENST00000509446 907 ntTSL 221.76■■□□□ 1.074e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 APBB2-205ENST00000503264 493 ntTSL 421.76■■□□□ 1.074e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.074e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 CCDC61-205ENST00000596161 574 ntTSL 421.72■■□□□ 1.072e-13■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.064e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 DNPEP-203ENST00000373963 1657 ntTSL 521.61■■□□□ 1.054e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 APBB2-216ENST00000508707 639 ntTSL 221.55■■□□□ 1.044e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 ASL-207ENST00000487982 1007 ntTSL 221.45■■□□□ 1.024e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.024e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 14e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.3■■□□□ 14e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 14e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 RFC2-207ENST00000480432 871 ntTSL 321.2■□□□□ 0.984e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.984e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 ST6GAL1-217ENST00000463542 516 ntTSL 421.11■□□□□ 0.974e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 ETS2-203ENST00000432278 1033 ntTSL 521.08■□□□□ 0.974e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 PTCH1-227ENST00000553256 537 ntTSL 421.05■□□□□ 0.964e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.964e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.964e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.954e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 NGLY1-211ENST00000474611 478 ntTSL 320.98■□□□□ 0.954e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 CHN1-207ENST00000425395 873 ntTSL 320.98■□□□□ 0.954e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 HIF1AN-203ENST00000526476 708 ntTSL 320.86■□□□□ 0.932e-13■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.934e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.934e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 MRPL11-206ENST00000534488 812 ntTSL 220.83■□□□□ 0.934e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.914e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 C12orf57-203ENST00000538392 979 ntTSL 220.69■□□□□ 0.94e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.94e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.94e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 SIPA1L1-204ENST00000553453 521 ntTSL 520.63■□□□□ 0.894e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 BPTF-208ENST00000544778 7573 ntTSL 520.5■□□□□ 0.874e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.864e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 KCTD13-206ENST00000566842 1860 ntTSL 220.4■□□□□ 0.864e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.854e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 AGTRAP-211ENST00000494437 976 ntTSL 320.39■□□□□ 0.854e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 PRNP-202ENST00000424424 806 ntTSL 1 (best)20.38■□□□□ 0.854e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.854e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 CHN1-211ENST00000451799 569 ntTSL 420.35■□□□□ 0.854e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 CMTR1-205ENST00000475364 1032 ntTSL 520.33■□□□□ 0.854e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.834e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 NT5C2-207ENST00000461461 902 ntTSL 520.27■□□□□ 0.834e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 MMAB-205ENST00000537496 1188 ntTSL 220.23■□□□□ 0.834e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.824e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 CACNB1-205ENST00000536613 575 ntTSL 420.17■□□□□ 0.824e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 ARVCF-207ENST00000473551 2108 ntTSL 220.16■□□□□ 0.824e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 TAGLN2-204ENST00000397334 801 ntTSL 520.12■□□□□ 0.814e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.84e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 MRPL9-208ENST00000481777 390 ntTSL 520.05■□□□□ 0.84e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 EPHX1-204ENST00000448202 895 ntTSL 220.04■□□□□ 0.84e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 MRPL9-203ENST00000461182 348 ntTSL 219.95■□□□□ 0.784e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.774e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 MBTPS1-215ENST00000570012 582 ntTSL 519.87■□□□□ 0.774e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 RNF207-203ENST00000466994 1854 ntTSL 219.85■□□□□ 0.774e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 MCM2-207ENST00000477668 2510 ntTSL 219.83■□□□□ 0.774e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.764e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 BORCS8-MEF2B-201ENST00000354191 1695 ntTSL 219.8■□□□□ 0.764e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.764e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.764e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.754e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 GRN-205ENST00000586443 1557 ntTSL 319.73■□□□□ 0.754e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 CHN1-215ENST00000488080 1852 ntTSL 1 (best)19.69■□□□□ 0.744e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 ZCCHC2-202ENST00000585873 5652 ntTSL 1 (best)19.68■□□□□ 0.744e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 PES1-212ENST00000488719 1732 ntTSL 219.65■□□□□ 0.744e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 INPP5A-207ENST00000498337 565 ntTSL 319.59■□□□□ 0.734e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 AGTRAP-209ENST00000476512 942 ntTSL 319.59■□□□□ 0.734e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.724e-7■■■■■ 133.7
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 1596.1 ms