Protein–RNA interactions for Protein: O60636

TSPAN2, Tetraspanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN2O60636 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TSPAN2O60636 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms