Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYTH3O43739 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYTH3O43739 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYTH3O43739 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYTH3O43739 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYTH3O43739 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CYTH3O43739 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYTH3O43739 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYTH3O43739 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYTH3O43739 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYTH3O43739 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYTH3O43739 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYTH3O43739 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYTH3O43739 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CYTH3O43739 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYTH3O43739 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYTH3O43739 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYTH3O43739 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYTH3O43739 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYTH3O43739 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYTH3O43739 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYTH3O43739 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYTH3O43739 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CYTH3O43739 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYTH3O43739 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYTH3O43739 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYTH3O43739 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYTH3O43739 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYTH3O43739 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYTH3O43739 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYTH3O43739 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYTH3O43739 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CYTH3O43739 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYTH3O43739 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYTH3O43739 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYTH3O43739 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CYTH3O43739 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYTH3O43739 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYTH3O43739 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYTH3O43739 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYTH3O43739 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYTH3O43739 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYTH3O43739 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYTH3O43739 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYTH3O43739 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYTH3O43739 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYTH3O43739 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYTH3O43739 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYTH3O43739 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYTH3O43739 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYTH3O43739 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYTH3O43739 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYTH3O43739 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYTH3O43739 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYTH3O43739 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYTH3O43739 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYTH3O43739 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYTH3O43739 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYTH3O43739 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYTH3O43739 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CYTH3O43739 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYTH3O43739 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYTH3O43739 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CYTH3O43739 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYTH3O43739 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYTH3O43739 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CYTH3O43739 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYTH3O43739 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CYTH3O43739 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYTH3O43739 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYTH3O43739 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYTH3O43739 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYTH3O43739 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CYTH3O43739 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYTH3O43739 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CYTH3O43739 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYTH3O43739 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CYTH3O43739 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CYTH3O43739 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYTH3O43739 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYTH3O43739 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CYTH3O43739 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CYTH3O43739 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYTH3O43739 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CYTH3O43739 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYTH3O43739 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CYTH3O43739 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYTH3O43739 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CYTH3O43739 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYTH3O43739 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYTH3O43739 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CYTH3O43739 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CYTH3O43739 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYTH3O43739 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYTH3O43739 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CYTH3O43739 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYTH3O43739 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CYTH3O43739 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CYTH3O43739 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYTH3O43739 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms