Protein–RNA interactions for Protein: O14817

TSPAN4, Tetraspanin-4, humanhuman

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4O14817 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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TSPAN4O14817 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN4O14817 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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