Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms