Protein–RNA interactions for Protein: H7C241

CLDN34, Claudin-34, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN34H7C241 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms