Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
H7C1D1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
H7C1D1 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
H7C1D1 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H7C1D1 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
H7C1D1 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
H7C1D1 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
H7C1D1 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H7C1D1 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
H7C1D1 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
H7C1D1 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
H7C1D1 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
H7C1D1 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
H7C1D1 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
H7C1D1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
H7C1D1 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
H7C1D1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
H7C1D1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
H7C1D1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
H7C1D1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
H7C1D1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H7C1D1 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H7C1D1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H7C1D1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H7C1D1 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H7C1D1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
H7C1D1 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
H7C1D1 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H7C1D1 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
H7C1D1 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
H7C1D1 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
H7C1D1 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
H7C1D1 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
H7C1D1 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
H7C1D1 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
H7C1D1 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
H7C1D1 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H7C1D1 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H7C1D1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
H7C1D1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H7C1D1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H7C1D1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H7C1D1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
H7C1D1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H7C1D1 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H7C1D1 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
H7C1D1 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
H7C1D1 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
H7C1D1 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
H7C1D1 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H7C1D1 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
H7C1D1 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
H7C1D1 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
H7C1D1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H7C1D1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H7C1D1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
H7C1D1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
H7C1D1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H7C1D1 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
H7C1D1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H7C1D1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
H7C1D1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
H7C1D1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H7C1D1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H7C1D1 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
H7C1D1 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
H7C1D1 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
H7C1D1 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
H7C1D1 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
H7C1D1 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
H7C1D1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H7C1D1 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
H7C1D1 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
H7C1D1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H7C1D1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
H7C1D1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
H7C1D1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H7C1D1 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H7C1D1 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H7C1D1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
H7C1D1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H7C1D1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
H7C1D1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H7C1D1 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
H7C1D1 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
H7C1D1 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
H7C1D1 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
H7C1D1 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
H7C1D1 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
H7C1D1 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H7C1D1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
H7C1D1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H7C1D1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H7C1D1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
H7C1D1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
H7C1D1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
H7C1D1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H7C1D1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H7C1D1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H7C1D1 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms