Protein–RNA interactions for Protein: H7BZ55

CROCC2, Putative ciliary rootlet coiled-coil protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCC2H7BZ55 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CROCC2H7BZ55 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CROCC2H7BZ55 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CROCC2H7BZ55 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CROCC2H7BZ55 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CROCC2H7BZ55 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CROCC2H7BZ55 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CROCC2H7BZ55 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CROCC2H7BZ55 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CROCC2H7BZ55 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CROCC2H7BZ55 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CROCC2H7BZ55 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CROCC2H7BZ55 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CROCC2H7BZ55 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CROCC2H7BZ55 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CROCC2H7BZ55 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CROCC2H7BZ55 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CROCC2H7BZ55 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CROCC2H7BZ55 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms