Protein–RNA interactions for Protein: E5RI56

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E5RI56 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
E5RI56 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
E5RI56 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E5RI56 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
E5RI56 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
E5RI56 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E5RI56 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E5RI56 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
E5RI56 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E5RI56 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E5RI56 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E5RI56 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E5RI56 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E5RI56 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E5RI56 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E5RI56 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E5RI56 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E5RI56 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E5RI56 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E5RI56 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E5RI56 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E5RI56 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E5RI56 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
E5RI56 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E5RI56 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E5RI56 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E5RI56 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E5RI56 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E5RI56 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E5RI56 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E5RI56 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E5RI56 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E5RI56 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E5RI56 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E5RI56 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E5RI56 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E5RI56 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E5RI56 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
E5RI56 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E5RI56 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E5RI56 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E5RI56 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E5RI56 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
E5RI56 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E5RI56 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E5RI56 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E5RI56 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E5RI56 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E5RI56 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E5RI56 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E5RI56 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E5RI56 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E5RI56 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E5RI56 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E5RI56 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E5RI56 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E5RI56 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
E5RI56 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E5RI56 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E5RI56 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E5RI56 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E5RI56 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E5RI56 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E5RI56 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E5RI56 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E5RI56 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E5RI56 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
E5RI56 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
E5RI56 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E5RI56 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E5RI56 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
E5RI56 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E5RI56 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E5RI56 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E5RI56 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E5RI56 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E5RI56 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E5RI56 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
E5RI56 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E5RI56 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E5RI56 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E5RI56 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E5RI56 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E5RI56 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E5RI56 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
E5RI56 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E5RI56 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E5RI56 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E5RI56 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E5RI56 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E5RI56 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
E5RI56 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E5RI56 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E5RI56 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E5RI56 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E5RI56 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
E5RI56 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E5RI56 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E5RI56 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
E5RI56 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms