Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms