Protein–RNA interactions for Protein: A4QMS7

C5orf49, Uncharacterized protein C5orf49, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf49A4QMS7 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C5orf49A4QMS7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms