Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms