Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms