Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms