Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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