Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP18Q9UMW8 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
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