Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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