Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT7

FBXL3, F-box/LRR-repeat protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL3Q9UKT7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXL3Q9UKT7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms