Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms