Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.32■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC21.31■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.31■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.31■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.3■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.3■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.3■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.3■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms