Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms