Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms