Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms