Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV7

ZIM2, Zinc finger imprinted 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIM2Q9NZV7 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZIM2Q9NZV7 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms