Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 MAP3K14-205ENST00000617331 1049 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms