Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNTG1Q9NSN8 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms