Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms