Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC31BQ9NQW1 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms