Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD87

C6orf50, Putative uncharacterized protein C6orf50, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf50Q9HD87 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.3■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.3■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.3■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.3■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.29■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.29■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.29■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.27■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C6orf50Q9HD87 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms