Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZL7

WDR12, Ribosome biogenesis protein WDR12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR12Q9GZL7 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR12Q9GZL7 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms