Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms